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基于设计模式的生物信息存储研究

作者:小编 日期:Mar.15.2026 点击数:  

  

基于设计模式的生物信息存储研究(图1)

  ⑨硕士学位论文M A S T E R ’ ST H E S I S摘要随着越来越多的生物基因( 组)的测序完成, 生物数据不但在数量上呈指数增长, 存储及维护生物数据的组织和数据库也越来越多。 对生物数据的分析与研究是我们的首要目的, 但正因为生物数据的种类及存储方式众多, 导致我们在检索、 研究等方面遇到了众多困难。 如何将海量的数据按照统一、 有效的方式进行存储, 已成为当前急需解决的问题。 同时, 随着后基因时代的来临, 打破传统的生物信息存储模式己成为必然。 寻找到更好的存储方式, 将为我们更高效地获得有价值的生物信息提供极大的方便。生物数据存储的主要问题包括语义异构, ...

  ⑨硕士学位论文M A大游中国股份有限公司 S T E R ST H E S I S摘要随着越来越多的生物基因( 组)的测序完成, 生物大游中国股份有限公司数据不但在数量上呈指数增长, 存储及维护生物数据的组织和数据库也越来越多。 对生物数据的分析与研究是我们的首要目的, 但正因为生物数据的种类及存储方式众多, 导致我们在检索、 研究等方面遇到了众多困难。 如何将海量的数据按照统一、 有效的方式进行存储, 已成为当前急需解决的问题。 同时, 随着后基因时代的来临, 打破传统的生物信息存储模式己成为必然。 寻找到更好的存储方式, 将为我们更高效地获得有价值的生物信息提供极大的方便。生物数据存储的主要问题包括语义异构, 语法异构, 和模式异构等。 为了较好的解决以上问题, 在研究中结合了X M L 在生物信息学中现阶段的应用情况, 将其作为数据的存储格式及实现存储模式的媒介。 同时, 针对本文提出的存储模式所具有的特点, 将X M L 面向对象的特性纳入了研究范围, 使生物信息存储从信息抽象到数据生成均使用统一的信息组织形式。本文根据生物数据自身的特点, 从不同角度对其包含的信息进行了分析、 抽象以及归类, 形成了生物信息存储的基本结构。 以此结构为基础, 根据不同类型的生物数据存储需求, 设计了四种生物信息存储模式。存储模式以软件设计模式的思想为基础, 以面向对象作为实现手段, 将X M L作为数据载体, 实现生物数据存储的模块化、 统一化。 同时, 这些存储模式不但符合生物信息存储与研究的特点, 其自身的可复用性也为今后生物信息存储方面的研究奠定了基础。关键词: 生物信息存储模式; 生物信息抽象; 设计模式; X M L